房屋的产权与土地是紧密关联的，只有完成证明登记，并且所有权主体为同一人，房屋产权人的合法权益才能得到有效的保护。
购买只有房产证没有土地证的房子，在房屋过户手续中，必须提交房产证、土地证和契税证，否则无法过户。因此，如果房屋只有房产证而没有土地证，那么过户就无法通过。如果无法完成过户手续，就无法落户，这是购房者要面对的现实问题。
根据法律规定，农村房屋的买卖必须涉及宅基地使用权的转让。由于宅基地的所有权属于农村集体经济组织，只有集体经济组织的成员才能申请使用，因此这类房产只有房产证而没有土地证，且不允许转让。即使购买了这样的房产，房屋买卖协议也是无效的。如今，各地房产涨价较快，如果购买这种没有土地证的房产，日后权益会受到损害，因此应尽量避免购买这类房产。
只有房产证没有土地证会对房屋交易产生影响。
首先，难以了解土地使用权上的抵押权情况，也就无法及时避免风险。
其次，难以发现开发商违规用地的情况。
另外，二手房交易也会受到影响。《城市房地产管理法》规定，房地产上市交易必须出示房屋所有权证和国有土地使用权证。
最后，在拆迁补偿时也会受到损失。《城市房屋拆迁估价指导意见》第三条规定，房屋拆迁评估价格为拆迁房屋的房地产市场价格，因此，拆迁补偿金不仅包括房屋所有权价值，还包括土地使用权价值。如果购房者未办理土地使用权证，就可能在拆迁过程中失去土地使用权的相应补偿。
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