公积金能够用来贷款购房，在办理公积金贷款时，如果有补充公积金账户，贷款额度也会更高。但是，基本公积金和补充公积金之间存在一些不同之处。
首先，在必要性、覆盖面、缴存金额和实施流程上，基本公积金和补充公积金存在差异。基本公积金是强制性的，员工在与雇主建立劳动关系后就必须购买；而补充公积金是自愿选择购买的。基本公积金适用于中国境内的任何企业，而补充公积金只适用于足额缴纳税款的企业和自收自支的事业单位以及具有本市城镇常住户口的职工。国家机关、差额预算事业单位和社会团体不购买补充公积金，因此补充公积金并不覆盖所有企业和城市，例如深圳便不允许购买。
其次，基本公积金和补充公积金的缴存金额也不同。基本公积金缴纳基数为员工上一年度月平均工资，缴纳比例为5-12%；而补充公积金的缴存基数与基本公积金相同，但个人和单位的缴存比例分别不得高于9%和低于1%。
最后，在实施流程方面，基本公积金和补充公积金也各有特点。基本公积金可以在员工入职后30天内为其购买，无需经过审核；而购买补充公积金的单位则需要先经过本单位职工代表大会（外商投资企业需经过企业工会）讨论通过，报上级主管部门（外商投资企业需报董事会）审核同意，并报市公积金管理中心备案。
公积金包括住房公积金和公司公积金。住房公积金是由国家机关、国有企业、城镇集体企业、外商投资企业、城镇私营企业、事业单位、民办非企业单位、社会团体及其在职职工缴存的长期住房储金。而补充公积金制度是住房公积金制度的一种补充，用于职工的住房消费，属于职工个人所有。个人可以选择缴纳，缴纳比例不得超过7%，单位不得少于1%。因为基本公积金账号和补充公积金账号存在关联，所以在办理冲还贷手续时，只需要提供基本公积金账号即可。计算机会按照特定规则自动从对应的补充公积金账户内进行扣款，先扣基本公积金账户，再扣补充公积金账户。
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