1. 名称不同
不动产权证和房产证的主要区别是名称不同。房产证全称为中华人民共和国房地产权证，而不动产证全称为中华人民共和国不动产权证书。
2. 内容不同
房产证和不动产证在内容上也存在差异。房产证包含房屋所有权人、共有情况、房屋坐落、登记时间、房屋性质、规划用途、房屋状况和土地状况等信息；而不动产权证则增加了镭射区、不动产单元号、适用期限等内容。
3. 发证机关不同
不动产权证和房产证的发证机关也不同。房产证由市（县）房地产管理局（房产管理局）或市（县）人民政府发证，印章上标注该信息；而不动产权证由县级以上人民政府依法确定的、统一负责不动产登记工作的部门发证，印章上标注XX县国土资源局不动产登记专用章。
4. 费用不同
不动产证和房产证办理时需要缴纳的费用也有所不同。办理房产证时，需要按照土地面积、房产面积分别进行两次测绘，并缴纳两次测绘费用和两次制证成本费；而不动产证只需要进行一次测绘，制证成本费也只需缴纳一次。此外，在购房时，所有手续都可在不动产登记中心一站完成，无需多次跑部门。
5. 版本不同
不动产证有两个版本，包括单一版和集成版。单一版证书只记载一个不动产单元上的不动产权利；集成版证书则记载同一权利人在同一登记辖区内享有的多个不动产单元上的不动产权利。而房产证只有一个版本。
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