要区分经济适用房房产证与商品房房产证的区别，首先需要了解经济适用房的概念。因为经济适用房是为中低收入居民购房而实施的优惠措施，所以建造经济适用房所用的土地是国家划拨给开发商使用的，这就是为什么经济适用房价格低的主要原因。因此，经济适用房房产证所拥有的权利与普通商品房的权利会有一定的区别。下面我们就具体分析经济适用房房产证与商品房房产证的异同。
一、经济适用房房产证与商品房房产证的相同点：
就本质而言，经济适用房和普通商品房两者的房产证是没有区别的，都是购房者所拥有的房屋所有权的合法书面凭证。他们的财产权利受国家法律法规的规范和保护，不过在使用和交易方面存在一定的差别。
二、经济适用房房产证与商品房房产证的不同点：
1. 经济适用房房产证
在北京市，个人购买的经济适用房，房屋产权归购房者个人所有。一旦获得合法产权证书，购房者就可以根据法律进入二级市场进行交易，收益也全部归个人所有。换言之，经济适用房的产权证书拥有的权利和普通商品房的基本一致，唯一的区别在于经济适用房在出售时，购房者需要按照所在地标定的地价的10%交纳土地出让金，如果没有标定地价，就需要按照房屋售价的3%交纳土地出让金。经过产权过户手续办理后，购房者获得的证书就是普通商品房的产权证书，再次交易时就不需要再交纳土地出让金了。
2. 商品房房产证
完整的房屋所有权包括四项权利，即使用权、占有权、处置权和收益权。普通商品房的产权证书拥有这四项权利，只要不违反法律规定就可以自由地转让、出租或赠送，没有任何单位或个人的限制和干涉。其收益归购房者所有，除税费外，购房者不需要再交其他费用。
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