1、未来的使用费用不确定。对于50年产权的住宅，其水、电、暖等使用费用将采取商用价格，而普通住宅则按民用价格缴纳，购房者在购房时需要咨询清楚。目前，开发商大多在前期开发中采取相应的补救措施，以便购房者能按民用价格缴纳。
2、税费的差异。购买普通住宅时，初次购买和未来转让时契税为1.5%，而50年产权的住宅，其契税按3%缴纳。
3、贷款条件的限制。购买50年产权或40年产权的住宅，大多不能申请公积金贷款。但是有些开发商会努力协调，以便购房者可以申请公积金贷款。此外，如果采用银行贷款的方式购房，50年产权或40年产权的住宅只能得到五成或六成按揭。
4、建设标准不同。如果按照公建相关要求，50年产权住宅的人防和消防等建设标准较高，对开发商而言成本会提高，但对购房者的使用影响不大。
50年产权房到期后该怎么办？
1、房地产权属包括房屋建筑本身的所有权和所占土地的使用权。房屋建筑本身的所有权是终身享有的，可继承的。土地的使用权则是有期限的，一般所说的使用年限就是土地的合用权。
2、如果土地使用权到期，没有办理继期，如果动迁，只会补偿房屋所有权的钱(75%)左右，没有土地使用权的补偿(25%)左右。根据2006年出台的物权法规定，如果土地使用权到期，可以申请续期。对于住宅性质的土地使用权70年到期后，一般会自动续期，无需办理。商业性质的(40年使用权)到期后则需要重新办理，可能会涉及机关费用。对于其它性质的，如工业、旅游等(50年使用权)，也需要重新办理。按照物权法的解释，具体执行标准以当时的相关规定为准，因此现在没有明确的执行标准。
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