房屋契税的缴纳时间因地而异，有些地方规定在交房之前缴纳，有些地方则规定在合同签订满10天后缴纳。目前主流操作是，期房的房屋契税缴纳时间为房屋竣工验收合格、交付使用、办理房产证时缴纳。
契税的计算方式也有所不同。对于首套房且房屋面积小于或等于90平方米的，契税按照1%的税率收取；如果房屋面积大于90平方米，则按照1.5%的税率收取。对于二套房且房屋面积小于或等于90平方米的，契税按照1%的税率收取；如果房屋面积大于90平方米，则按照2%的税率收取。对于第三套房以上，不论房屋面积是多少，契税都按照3%的税率收取。
契税的计算公式也有所不同。对于新房，应纳税额=计税依据*税率；对于二手房，应纳税额=二手房税率*房地产评估价。契税的主要依据有四种：购房契税按照房屋的成交价格来算；购房契税必须根据市场价格来计算；购房契税依据土地、房屋交换差价来定税；购房契税按照土地的收益来定价，但这种情况并不常见。
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