二套房的契税是按照成交价的3%计算缴纳的。一般来说，购买首套房的契税比购买二套房的契税要少一些。对于个人购买家庭唯一住房，面积为90平方米以上的，减按1.5%的税率征收契税。而对于个人购买家庭第二套改善性住房，面积为90平方米以上的，减按2%的税率征收契税。二套房契税一般是在交房之前需交纳，由开发商来收取。如果契税没有在指定时间内缴纳，需要另外缴纳滞纳金。
关于二套房契税的退税条件，有以下三种情况。首先，如果纳税人已按预售面积、预售房款缴纳契税，但办理房产证时发现实测面积与预售面积有误差，导致房款发生变化，致使纳税人多缴税款的，可以申请退税。其次，如果纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还。如果纳税人自缴纳税款之日起三年内发现多缴纳的税款，也可以向税务机关要求退还多缴纳的税款。最后，如果房屋交易不成立，买卖双方撤销原房屋销售合同，并签订有退房协议，在办理房产证之前可以申请退还已缴纳契税。对于已缴纳契税的购房单位和个人，在未办理房屋权属变更登记前退房的，可以退还已缴纳契税。但在办理房屋权属变更登记后退房的，不予退还已缴纳契税。
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